啟東市農(nóng)業(yè)農(nóng)村局內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)（19個(gè)）：
1、市委農(nóng)辦綜合科（發(fā)展規(guī)劃科）
2、市委農(nóng)辦督查考核科（農(nóng)村社會(huì)事業(yè)促進(jìn)科）
3、辦公室
4、人事科
5、法規(guī)科（行政服務(wù)科）
6、政策與改革科（農(nóng)村合作經(jīng)濟(jì)指導(dǎo)科）
7、計(jì)劃財(cái)務(wù)審計(jì)科
8、鄉(xiāng)村產(chǎn)業(yè)發(fā)展科（市場(chǎng)與信息化科）
9、種植業(yè)與科技教育科
10、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全監(jiān)管科
11、畜牧獸醫(yī)科（重大動(dòng)物疫病防控辦公室）
12、漁業(yè)科
13、漁政監(jiān)督管理科（禁捕退捕科）
14、農(nóng)機(jī)發(fā)展監(jiān)管科
15、農(nóng)田建設(shè)管理科（耕地質(zhì)量科）
16、農(nóng)業(yè)項(xiàng)目建設(shè)監(jiān)督評(píng)價(jià)科
17、扶貧工作科
18、沿江沿海安全管理科
19、安全生產(chǎn)監(jiān)管科
啟東市農(nóng)業(yè)農(nóng)村局下屬單位（10個(gè)）：
1、啟東市農(nóng)業(yè)綜合執(zhí)法大隊(duì)
2、啟東市農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心
3、啟東市蠶桑指導(dǎo)站
4、啟東市動(dòng)物疫病防控中心
5、啟東市農(nóng)村環(huán)保能源技術(shù)推廣站
6、啟東市農(nóng)業(yè)機(jī)械技術(shù)推廣站
7、啟東市農(nóng)村合作經(jīng)濟(jì)經(jīng)營(yíng)管理站
8、啟東市漁政監(jiān)督大隊(duì)
9、啟東市漁業(yè)技術(shù)推廣站
10、啟東市呂四漁港船閘管理所